İnci tanesi, kimyasal olarak başlıca aragonite ve kalsit karışımıdır, bazen biraz valerit de bu karışıma eklenir. Temelde hepsi kalsiyum karbonattan (CaCO3) oluşur. Denizde ya da tatlı suda yaşayan Midyeler kabuklarının içine giren yabancı moleküllerin (çoğunlukla kum taneleri) zarar vermesini önlemek için bu molekülleri kalsiyum karbonat içeren aragonit denilen bir madde ile kaplarlar. Bu madde sedef olarak bilinir ve istiridyenin iç yüzeyini de kaplar. .
Valerit çoğunlukla heksagonal simetrisi olan kristalografik bir yapı gösterir. Kalsiyum karbonatın dehidrasyonu ile oluşur. Kalsiyum karbonatın çözünmesi-dehidrasyonu işlemlerinin tekrarlanması ile valerit kalsite dönüşür. Kalsit biyomineralizasyonu bakteriler veya nadiren mantarlar tarafından indüklenebilir. Valerit renksiz/parlak görünümlü iken kalsit beyaz, sarı, kırmızı, turuncu, mavi yeşil, kaverengi, gri renklerde olabilir. Bu şekilde kalsit ve aragonitten oldukça sert ve parlak görünümdeki inci tanesi oluşur.